یکی دیگر از چالش های مهمی که در هنگام طرح دعوی خلع ید به وجود می آید، چگونگی اجرای حکم خلع ید همراه با جزئیات آن است. پس از آن که روند بررسی پرونده مذکور با موفقیت پیش رفت نوبت به صدور حکم از سوی دادگاه می رسد. در این زمان فرد شاکی با در دست داشتن حکم ابلاغ شده درخواست اجرای آن را به بخش احکام مدنی مطرح می نماید. پس از گذشت این مرحله در نهایت مامور اجرا، عملیات بازپس گیری ملک متصرف شده را آغاز می کند. پس از موفقیت در انجام مراحل فوق، مامور اجرای حکم گزارش مورد نظر را به مرجع صادر کننده ارائه می نماید.