علی‌رغم وجود شباهت‌های جرایم مالی و جرایم اقتصادی، تفاوت‌هایی نیز دارند. جرایم مالی، جرایمی هستند که مبحث آن‌ها اموال و مالکیت افراد باشد. یعنی جرایمی که علیه اموال و مالکیت اشخاص صورت بگیرد، جرایم مالی هستند. ولی جرایم اقتصادی، جرایمی را شامل می‌شوند که نظام اقتصادی کشور را هدف گرفته‌اند.

در حقیقت جرایم اقتصادی تاثیر زیان‌بارتری را در پی دارند. در قوانین حقوقی کشورمان جرایم مالی و اقتصادی تعریف مشخصی ندارند و صرفا مصادیق آن‌ها در قانون بیان و مجازات مشخص شده است. به همین علت تفکیک جرایم مالی از اقتصادی در نظام حقوقی ایران کار آسان نیست. موارد زیر به شکل کلی تفاوت‌های جرائم مالی و اقتصادی بیان شده‌اند.