مرجع رسیدگی به شکایات قصور پزشکی، سازمان نظام پزشکی است که بنابر تخصصی بودن موضوع از نظرات کارشناسی متخصصان مربوطه استفاده می‌کند. اقدام به رسیدگی جرائم و تخلفات پزشکی به واسطه یکی از موارد زیر شروع می‌شود:

.طرح شکایت از طرف بیمار، سرپرستان یا وکیل جرائم پزشکی

.گزارش اعلام تخلف توسط بازرسان سازمان نظام پزشکی

.گزارش تخلف از طرف سایر مراجع قضایی و غیرقضایی