اختلالات مربوط به درد‌های جنسی عمدتا به زنان محدود شده و در نتیجه عدم روان سازی کافی واژن در طی رابطه جنسی اتفاق می‌افتد. این امر ممکن است ناشی از عدم تحریک در رابطه با فعالیت جنسی یا تغییرات هورمونی ناشی از بارداری، شیردهی یا یائسگیباشد. دیگر دلایل عبارتست از سوزش، آزردگی ناشی از استفاده از کرم‌های ضد بارداری و اضطراب در رابطه جنسی.
درد‌های جنسی ممکن است ناشی از وضعیتی بنام واژینیسموس(انقباض غیر ارادی واژن) نیز باشد که در این حالت ماهیچه‌های دیواره واژن به هنگام مقاربت جنسی به صورت غیر ارادی اسپاسم می‌کنند (منقبض می‌شوند).
علت این اسپاسم‌ها مشخص نیست، اما آسیب‌های روانی ناشی از رابطه جنسی قبلی مانند سوء استفاده یا تجاوز، از عوامل تحریک‌کننده چنین شرایطی به شمار می‌آید.
یک مورد اختلال جنسی که در مردان اتفاق می‌افتد، «نعوظ مانا» است که نعوظی دردناک است و ممکن است برای چندین ساعت حتی در صورت عدم تحریک جنسی ادامه یابد. این امر ناشی از گیر افتادن خون در آلت تناسلی و عدم تخلیه کامل خون است. در صورت عدم درمان، این وضعیت ممکن است منجر به از دست رفتن دائم عملکرد نعوظ گردد.
